科研服务——空间转录组和空间表观组学解决方案

服务介绍

女娲生命引入创新的空间组学技术,通过 “高分辨率空间定位” 与 “多组学维度的整合解析”,为您呈现组织功能的完整空间图谱,助力揭示未被发现的生物学机制。

技术范围

◈ 空间转录组RNA测序:单个细胞内可以覆盖2000-4000个基因;

◈ 空间DNA甲基化图谱测量:单个细胞尺度,提供单碱基分辨率的全基因组甲基化图谱;

◈ 空间染色质可及性ATAC测序:单个细胞尺度,高覆盖度;

◈ 空间转录组RNA+DNA甲基化双组学测序:同一个细胞内转录组和DNA甲基化图谱同时获得;

◈ 空间转录组RNA+ATAC双组学测序:同一个细胞内转录组和染色体可及性图谱同时获得。

技术优势

多组学空间解析
可获取转录组,DNA甲基化组,染色质开放性,染色体高级结构的多组学检测,实现多分子层面数据的空间关联与机制互证

多组学空间解析

可获取转录组,DNA甲基化组,染色质开放性,染色体高级结构的多组学检测,实现多分子层面数据的空间关联与机制互证

超高空间分辨率
达单细胞尺度分辨率,可有效区分单细胞及邻近细胞的空间异质性,精准解析细胞微环境的结构特征,突破传统技术 “批量平均化” 的解析局限

超高空间分辨率

达单细胞尺度分辨率,可有效区分单细胞及邻近细胞的空间异质性,精准解析细胞微环境的结构特征,突破传统技术 “批量平均化” 的解析局限

数据可靠性与重复性
基于微流控技术的方案,保障条形码递送的均一性与靶向性,数据信噪比高、重复性稳定,为科研发现提供可靠支撑,满足高水平研究的验证需求

数据可靠性与重复性

基于微流控技术的方案,保障条形码递送的均一性与靶向性,数据信噪比高、重复性稳定,为科研发现提供可靠支撑,满足高水平研究的验证需求

覆盖多基因检测
高数量、覆盖度的检测需求,可根据研究方向精准覆盖关键功能基因,助力更深度的生物学机制挖掘

覆盖多基因检测

高数量、覆盖度的检测需求,可根据研究方向精准覆盖关键功能基因,助力更深度的生物学机制挖掘

全流程解决方案
提供从实验设计、样本处理、文库构建、测序到生物信息分析的一体化CRO服务,支持定制化分析需求,助力从样本直接获取发表级数据解读与可视化结果

全流程解决方案

提供从实验设计、样本处理、文库构建、测序到生物信息分析的一体化CRO服务,支持定制化分析需求,助力从样本直接获取发表级数据解读与可视化结果

服务流程

定制化方案设计

样本标准化接收

实验执行与测序

实验执行与测序

生物信息分析

生物信息分析

成果交付与解读

技术应用领域

 肿瘤生物学

  • 肿瘤微环境的空间解构
  • 免疫治疗响应机制研究
  • 肿瘤异质性与转移路径

 发育生物学

  • 胚胎发育的时空图谱构建
  • 类器官模型的空间验证

 神经科学

  • 大脑区功能的精细解析
  • 神经退行性疾病机制

 免疫与感染疾病

  • 感染应答的空间动态
  • 自身免疫病的病灶解析

分析内容

析内 空间转录组 / 空间表观组

数据处理

数据质控

数据比对

表达定量/基因组覆盖度/DNA甲基化/染色体开放性/染色体高级结构

分析

Space Ranger (PCA降维,聚类/降维分析)

差异化分析

小提琴图

聚类热图

空间位置展示

T-SINE/UMAP展示

富集分析

Reactome 富集分析

聚类GO 富集分析热图

KEGG 富集分析

高级分析

Spot 定义

轨迹分析

特征分析

结果展示

空间组的细胞分类注释图

空间组的细胞分类注释图

空间特异表达基因分析图

空间特异表达基因分析图

空间组学细胞图谱

空间组学细胞图谱

细胞间信号通路的时空动态与定位图谱

细胞间信号通路的时空动态与定位图谱

基因表达空间定位图谱

基因表达空间定位图谱

案例介绍

A high-definition spatiotemporal transcriptomic atlas of mammalian kidney development.The Innovation.202504(IF=33.2)

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